Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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