Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms