Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms