Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Colec11Q3SXB8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Colec11Q3SXB8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Colec11Q3SXB8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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