Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl9Q32KG4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl9Q32KG4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl9Q32KG4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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