Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms