Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms