Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms