Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms