Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms