Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vps8Q0P5W1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms