Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms