Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms