Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata4Q08369 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms