Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms