Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr5Q04683 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms