Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms