Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nhlh1Q02576 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlh1Q02576 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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