Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snai1Q02085 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms