Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcpQ01853 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcpQ01853 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms