Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp1Q01514 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp1Q01514 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms