Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms