Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pde1bQ01065 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms