Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms