Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms