Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cited1P97769 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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