Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms