Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms