Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkn1P70268 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkn1P70268 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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