Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbx1P62878 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms