Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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