Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snap25P60879 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms