Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms