Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtnsP57757 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms