Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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