Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn18P56857 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn18P56857 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn18P56857 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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