Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
StomP54116 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
StomP54116 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
StomP54116 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
StomP54116 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
StomP54116 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
StomP54116 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
StomP54116 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms