Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms