Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms