Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FmodP50608 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FmodP50608 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FmodP50608 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms