Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms