Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms