Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms