Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms