Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms