Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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