Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Traf1P39428 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms