Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtlP38585 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtlP38585 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms