Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprkP35822 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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