Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pola1P33609 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pola1P33609 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms